[[File:Intramurosjf0791 06.JPG|right|thumb|Colegio de Santa Rosa - Intramuros|alt=Intramurosjf0791 06.JPG]]
Nagtatag din ng mga paaralang pambabae. Layunin ng mga ito na ihanda ang kababaihan alinman sa pagiging mabuting asawa at ina ng tahanan o sa pagmamadre. Ang ilang paaralan ay ang (Colegio de Santa Potenciana - 1589), (Colegio de Sta. Isabel - 1632), (Colegio de Santa Rosa - 1750), (Kumbento ng Asuncion - 1892), at (Colegio ng Concordia - 1896). Sa mga kolehiyong ito itinuturo ang Doctrina Christiana, [[Espanyol]], [[Latin]], Kasaysayan, [[Matematika]], [[Musika]], kagandahang-asal, pagpipinta, at sining-pantahanan tulad ng pananahi, pagbuburda, paggawa at pag-aayos ng mga bulaklak.
== Iba pang paaralang itinatag ==
Maliban dito, nagtatag ng iba pang mga paaralan at mga pamantasan. 3 unibersidad ang itinatag sa kapuluan. Ang una ay ang Unibersidad ng San Ignacio na tumagal hanggang 1766. Ang pangalawa ay ang Kolehiyo ng Nuestra Senora del Rosario na naging Unibersidad ng Santo Tomas. At ang pangatlo ay ang Unibersidad ng San Felipe na tumagal hanggang 1726.
