Wikipedia

ChemSpider

Ang ChemSpider ay isang libreng online na daluyang datos ng mga kemikal na pag-aari ng Royal Society of Chemistry.[3][4][5][6][7] Naglalaman ito ng impormasyon tungkol sa mahigit 100 milyong molekula mula sa higit sa 270 mga pinagmumulan ng datos, at bawat isa sa kanila ay may natatanging tagapagtukoy na tinatawag na ChemSpider Identifier.

ChemSpider
Nilalaman
PaglalarawanHigit sa 100 milyong estruktura ng kemikal, mga katangian, at kaugnay na impormasyon.
Lapat
Sentro ng PagsasaliksikCambridge, United Kingdom
Laboratoryo
Pag-abot
Websaytchemspider.com
Gamit
Iba pa
LisensiyaCreative Commons Attribution Share-alike[2]

Sources

baguhin

Ang mga pinagkukunan ng daluyang datos ay kinabibilangan ng:[8]

Mga propesyonal na daluyang datos

baguhin

Crowdsourcing

baguhin

Maaaring mabago ang daluyang datos ng ChemSpider gamit ang mga kontribusyon mula sa mga gumagamit, kabilang ang pagdeposito ng istruktura ng kemikal, pagdeposito ng mga spektra, at pag-aalaga ng mga gumagamit. Isa itong crowdsourcing na paraan upang makabuo ng isang online na daluyang datos ng kemistri. Ang crowdsourced na pag-aalaga ng data ay nakapag-produce ng isang diksyunaryo ng mga pangalan ng kemikal na kaugnay ng mga istruktura ng kemikal na ginamit sa mga text-mining na aplikasyon sa biomedical at kemikal na literatura.[10]

Gayunpaman, hindi ipinagpapaliban ang karapatan sa daluyang datos at hindi available ang data dump; sa katunayan, sinasabi ng FAQ na limitado lamang ang mga pag-download na pinapayagan:[11] kaya't hindi garantisado ang karapatan sa forking at hindi maaaring ituring ang proyekto bilang libre/bukas.

Mga Tampok

baguhin

Searching

baguhin

Narito ang ilang mga magagamit na search module:

  • Ang standard search ay nagpapahintulot ng pagtatanong para sa mga pangalan ng sistema, mga pangalan ng kalakalan at mga kasingkahulugan, pati na rin ang mga numero ng rehistro.
  • Ang advanced search ay nagpapahintulot ng interactive na paghahanap batay sa istruktura ng kemikal, kemikal na subistruktura, pati na rin gamit ang molekular na pormula at [[molecular weight}bigat ng molar]] na saklaw, CAS na mga numero, mga supplier, at iba pa. Maaaring gamitin ang paghahanap upang mapalawak o mapaliit ang mga resulta na nahanap na.
  • Ang paghahanap ng istruktura gamit ang mga mobile device ay maaaring gawin gamit ang mga libreng app para sa iOS (iPhone/iPod/iPad)[12] at para sa Android (operating system).[13]

Chemistry document mark-up

baguhin

Ginamit ang ChemSpider database kasama ng text mining bilang batayan ng chemistry document markup. Ang ChemMantis,[14] ang Chemistry Markup And Nomenclature Transformation Integrated System, ay gumagamit ng mga algorithm upang kilalanin at kunin ang mga pangalan ng kemikal mula sa mga dokumento at web page at i-convert ang mga pangalan ng kemikal sa mga estruktura ng kemikal gamit ang mga algorithm ng name-to-structure conversion at dictionary look-ups sa ChemSpider database. Ang resulta ay isang integrated system sa pagitan ng mga dokumento ng kemikal at paghahanap ng impormasyon sa pamamagitan ng ChemSpider mula sa higit sa 150 mga pinagkukunan ng data.

SyntheticPages

baguhin

Ang SyntheticPages ay isang libreng interaktibong database ng mga pamamaraan ng synthetic chemistry na pinamamahalaan ng Royal Society of Chemistry.[15] Ang mga gumagamit ay nag-aambag ng mga synthetic na pamamaraan na kanilang isinagawa para mailathala sa site. Ang mga pamamaraang ito ay maaaring mga orihinal na gawa, ngunit kadalasan ay batay sa mga reaksyon mula sa literatura. Citations sa orihinal na pamamahaging pamamaraan ay ibinibigay kung kinakailangan. Ang mga ito ay nire-review ng isang siyentipikong editor bago mailathala. Ang mga pahina ay hindi dumadaan sa pormal na peer-review tulad ng isang artikulo sa scientific journal, ngunit maaaring magbigay ng komento ang mga naka-log in na gumagamit. Ang mga komento ay sinusuri din ng mga siyentipikong editor. Layunin ng site na mangalap ng praktikal na karanasan kung paano magsagawa ng kapaki-pakinabang na chemical synthesis sa lab. Habang ang mga metodolohiyang eksperimento na nailathala sa isang karaniwang academic journal ay ipinapakita ng pormal at maikli, ang mga pamamaraan sa ChemSpider SyntheticPages ay ibinibigay ng may mas praktikal na detalye. Ang pagiging hindi pormal ay hinihikayat. Kasama rin ang mga komento ng mga nag-aambag. Ang iba pang mga publikasyon na may katulad na antas ng detalye ay ang Organic Syntheses at Inorganic Syntheses. Ang SyntheticPages site ay orihinal na itinayo nina Professors Kevin Booker-Milburn (University of Bristol), Stephen Caddick (University College London), Peter Scott (University of Warwick) at Max Hammond. Noong Pebrero 2010, inihayag ang isang pagsasanib[16] sa pagitan ng makina ng paghahanap ng istruktura ng kemikal ng Royal Society of Chemistry na ChemSpider at ang pagbuo ng ChemSpider|SyntheticPages (CS|SP).

Ibang serbisyo

baguhin

Maraming serbisyo ang available online. Kasama na rito ang pag-convert ng mga pangalan ng kemikal sa istruktura ng kemikal, ang pagbuo ng mga SMILES at InChI string, pati na rin ang pagpapredikta ng maraming physicochemical na parametro at ang integrasyon sa isang web service na nagbibigay-daan para sa NMR prediction.

Kasaysayan

baguhin

Ang ChemSpider ay nakuha ng Royal Society of Chemistry (RSC) noong Mayo 2009.[17] Bago ito nakuha ng RSC, ang ChemSpider ay pinamamahalaan ng isang pribadong kumpanya, ang ChemZoo Inc. Ang sistema ay unang inilunsad noong Marso 2007 sa isang beta release na anyo at lumipat sa ganap na paglulunsad noong Marso 2008.

Open PHACTS

baguhin

Ang ChemSpider ay nagsilbing imbakan ng mga kemikal na compound bilang bahagi ng Open PHACTS proyekto, isang Innovative Medicines Initiative. Ang Open PHACTS ay binuo gamit ang mga bukas na pamantayan, may bukas na access, at isang semantic web na pamamaraan upang malutas ang mga hadlang sa pagtuklas ng mga gamot na maliliit na molekula - magkakaibang mga pinagkukunan ng impormasyon, kakulangan ng mga pamantayan, at labis na impormasyon. [18]

Tignan din

baguhin

Sanggunian

baguhin
  1. ↑ Van Noorden, R. (2012). "Chemistry's web of data expands". Nature. 483 (7391): 524. Bibcode:2012Natur.483..524V. doi:10.1038/483524a. PMID 22460877.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (link)
  2. ↑ "ChemSpider Blog » Blog Archive » ChemSpider Adopts Creative Commons Licenses". www.chemspider.com. Inarkibo mula sa orihinal noong 2015-04-02. Nakuha noong 2014-03-21.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (link)
  3. ↑ Antony John Williams (Ene–Peb 2008). "ChemSpider and Its Expanding Web: Building a Structure-Centric Community for Chemists". Chemistry International. 30 (1).{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (link)
  4. ↑ Williams, A. J. (2008). "Public chemical compound databases". Current Opinion in Drug Discovery & Development. 11 (3): 393–404. PMID 18428094.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (link)
  5. ↑ Brumfiel, G. (2008). "Chemists spin a web of data". Nature. 453 (7192): 139. Bibcode:2008Natur.453..139B. doi:10.1038/453139a. PMID 18464701.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (link)
  6. ↑ Williams, A. J. (2011). "Chemspider: A Platform for Crowdsourced Collaboration to Curate Data Derived from Public Compound Databases". Collaborative Computational Technologies for Biomedical Research. pp. 363–386. doi:10.1002/9781118026038.ch22. ISBN 9781118026038.{{cite book}}: CS1 maint: date auto-translated (link)
  7. ↑ Pence, H. E.; Williams, A. (2010). "ChemSpider: An Online Chemical Information Resource". Journal of Chemical Education. 87 (11): 1123. Bibcode:2010JChEd..87.1123P. doi:10.1021/ed100697w.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (link)
  8. ↑ "Data Sources". Chemspider. Nakuha noong Mayo 16, 2019.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (link)
  9. ↑ "ChemSpider Blog » Blog Archive » The US EPA DSSTox Browser Connects to ChemSpider". ChemSpider. Agosto 23, 2008. Inarkibo mula sa orihinal noong 7 Nobyembre 2017. Nakuha noong 7 Nobyembre 2017.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (link)
  10. ↑ Hettne, K. M.; Williams, A. J.; Van Mulligen, E. M.; Kleinjans, J.; Tkachenko, V.; Kors, J. A. (2010). "Automatic vs. Manual curation of a multi-source chemical dictionary: The impact on text mining". Journal of Cheminformatics. 2 (1): 3. doi:10.1186/1758-2946-2-3. PMC 2848622. PMID 20331846.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (link)
  11. ↑ "ChemSpider Blog » Blog Archive » Who Would Like to Have the Entire ChemSpider Database?". www.chemspider.com. Inarkibo mula sa orihinal noong 2015-09-24. Nakuha noong 2014-04-18.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (link)
  12. ↑ "ChemSpider on the App Store". App Store.
  13. ↑ "ChemSpider Mobile - Android Apps on Google Play". play.google.com.
  14. ↑ Welcome ChemMantis to ChemZoo and a Call for Contributions from the Community, 2008-10-23, A. Williams,blog post Naka-arkibo 2015-09-24 sa Wayback Machine.
  15. ↑ "ChemSpider SyntheticPages". Royal Society of Chemistry. Nakuha noong 26 Hunyo 2012.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (link)
  16. ↑ "ChemSpider and SyntheticPages support synthetic chemistry". RSC Publishing. Royal Society of Chemistry. 2010-02-05. Inarkibo mula sa orihinal noong 26 Hulyo 2012. Nakuha noong 2012-06-26.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (link)
  17. ↑ "RSC acquires ChemSpider". Royal Society of Chemistry. 11 Mayo 2009. Nakuha noong 2009-05-11.{{cite news}}: CS1 maint: date auto-translated (link)
  18. ↑ Williams, A. J.; Harland, L.; Groth, P.; Pettifer, S.; Chichester, C.; Willighagen, E. L.; Evelo, C. T.; Blomberg, N.; Ecker, G.; Goble, C.; Mons, B. (2012). "Open PHACTS: Semantic interoperability for drug discovery". Drug Discovery Today. 17 (21–22): 1188–1198. doi:10.1016/j.drudis.2012.05.016. PMID 22683805.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (link)
Kinuha sa "https://tl.wikipedia.org/w/index.php?title=ChemSpider&oldid=2143629"